Nat Commun:全面的多组学分析揭示慢性淋巴细胞白血病的不同致病性过程
如今科学家们对慢性淋巴细胞白血病(CLL,chronic lymphocytic leukemia)的基因组图谱理解地越来越详细,这或许就对积累信息的背景提供了一定的挑战。近日,一篇发表在国际杂志Nature Communications上题为“Multi-platform profiling characterizes molecular subgroups and resistance networks in chronic lymphocytic leukemia”的研究报告中,来自乌尔姆大学等机构的科学家们通过分析多个层次的编码生物信息,对来自CLL患者的700多份肿瘤样本进行了全面的分析和分类。
通过详细绘制相关的衍生信息,研究人员识别出了与对不同疗法组合产生不同模式耐药性相关的主要生物类别。除了表明炎症活动的异质性水平的变化外,基因组不稳定性的程度也被证明是肿瘤亚群的一个主要鉴别特征。在癌症生物学中,高水平的基因组不稳定性会增加基因组发生改变的可能性,这主要取决于肿瘤识别并修复获得性DNA损伤的能力。CLL中的基因组不稳定性与编码基因组保护的“细胞观察者”区域的突变或染色体丢失有关。
表现为肿瘤抑制基因失活的肿瘤通常治疗结果不佳,而早期发现或能帮助研究人员给予患者选择最合适的疗法;然而,基因组不稳定性往往发生在很多CLL病例中,而并没有这种能检测到的改变。文章中,研究者指出,对肿瘤样本的分析包括评估基因突变、染色体畸变、DNA甲基化、基因和蛋白质表达以及相关的通路信号活性。
如今研究人员能对肿瘤生物学解码,并以一种特殊的方式来翻译背后的信息,从而使其能够对肿瘤进行分类,而并不考虑检测到肿瘤抑制子或DNA修复基因的损失或突变。进一步研究后研究者发现,基因组不稳定的肿瘤不仅会关闭DNA的修复,还会展示出增强和高度的易错修复活性,这就进一步增加了基因组改变的积累率,并能加速耐受性的发生。
本文研究的另一个主要亚组展示出了最低程度的基因组不稳定性,且能表现出在实体瘤转移发生过程中所观察到的特征,研究人员此前并不知道这些特征能在CLL中建立亚群特定的功能网络。CLL细胞能通过血流抵达机体的任何部位,因此,发展出使得细胞能从肿瘤部位脱离从而找到更好的生存生境的机制似乎是多余的,这一点能通过研究实体瘤的转移过程得以体现。然而,这些未发现的网络或许会增加白血病细胞离开血流并迁移到淋巴组织中的能力,多种靶向性疗法或能解决相关的机制以及细胞在淋巴组织中的积累能力。
目前研究人员所建立的肿瘤分类代表了他们理解基础生物学和癌细胞耐受性机制方面的重大进展,最终或能改善CLL剂可能的其它实体肿瘤的个体化疗法方案的预后模型。综上,本文研究结果扩展了科学家们对CLL生物学即TP53野生型CLL风险类别的理解,此外,研究者在每个亚群中所识别出的分子靶点或为其后期开发新型治疗性策略提供了新的机会。(生物谷Bioon.com)
原始出处:
Bloehdorn, J., Braun, A., Taylor-Weiner, A. et al. Multi-platform profiling characterizes molecular subgroups and resistance networks in chronic lymphocytic leukemia. Nat Commun 12, 5395 (2021). doi:10.1038/s41467-021-25403-y
文章摘自网络,侵删
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