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KRAS抑制剂的“前世今生”

发表时间:2020-11-06 23:00:00

 

  KRAS是一种GTP酶,可催化三磷酸鸟苷(GTP)水解为二磷酸鸟苷(GDP)。当与GTP结合时,KRAS处于激活状态,相反,与GDP结合时处于失活状态。通过在激活和失活状态间切换,KRAS控制着多种不同的细胞功能。

  GTPase激活蛋白(GAPs,如NF1)可增强KRAS的GTP酶活性,促进与KRAS结合的GTP水解成为GDP,从而抑制KRAS的激活;而鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEFs,如SOS1/2)可增强GDP向GTP转换,催化KRAS与GTP的结合,从而促进KRAS的激活。

  KRAS通过激活多种效应蛋白来控制大量的细胞功能。被研究最充分的效应器包括RAF激酶和磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)的催化亚基。KRAS-GTP与RAF激酶结合可刺激其二聚化和激活,从而触发MEK和ERK的逐步激活,这是驱动细胞周期进展和增殖的一条通路。通过与PI3K结合,KRAS帮助激活AKT和MTOR,而AKT和MTOR调节细胞凋亡、代谢和翻译。

  KRAS突变发生于约25%的癌症病例中,主要见于肺癌、胰腺癌和结直肠癌,与极差的疾病预后有关。其中,KRAS(G12C)突变是最常见的KRAS突变之一,具体指KRAS 12位的甘氨酸(glycine)突变为半胱氨酸(cysteine)。该突变存在于~13%的肺腺癌,~3%的结直肠癌、~2%的子宫癌和~1%的间皮瘤中,胰腺癌(<1%)、宫颈癌(<1%)、膀胱癌(<1%)和胃癌(<1%)中也有低比例的KRAS(G12C)突变。

  在患者中有效靶向KRAS信号传导一直非常困难。一方面,由于RAS GTP酶对核苷酸有非常高的亲和力,因此,很难开发有效的竞争性抑制剂。另一方面,靶向KRAS在质膜上的定位(KRAS激活的关键步骤)也无效,因为许多代偿途径可调控这一过程。类似的,靶向KRAS下游效应信号也没有产生显著的临床效益。

  此外,由于KRAS蛋白表面除了一个GTP结合口袋,其它部分非常光滑,药物研发人员很难在其表面找到小分子候选药物的结合口袋,因为,KRAS靶向疗法的研发在先前的几十年中遭遇了很大的挫折,鲜有突破进展。

  不过,2013年发表在Nature上的一篇论文使KRAS靶向药物的研发迎来了转折。加州大学旧金山分校的化学生物学家Kevan Shoka团队发现KRAS(G12C)突变新引入的半胱氨酸很容易形成共价键,并设计出了能够不可逆地靶向KRAS的12号密码子上的半胱氨酸残基的共价小分子抑制剂。从那时起,KRAS(G12C)靶向药物的研发进入了全新的发展时期。

  10月15日,发表在Cell杂志上的一篇题为“Targeting KRAS(G12C): From Inhibitory Mechanism to Modulation of Antitumor Effects in Patients”的PERSPECTIVE中,来自Memorial Sloan Kettering癌症中心的3位科学家,回顾了KRAS(G12C)选择性抑制剂近几年令人兴奋的研究进展,并讨论了这些新疗法的作用机制、细胞效应以及患者疗效。以下摘编其中部分内容,供参考学习:

  一、KRAS(G12C)抑制剂

  直接靶向KRAS突变体是科学家们的长期目标。最早的工作可追溯到上世纪80年代,当时研究者们发现,人类癌细胞中有激活的RAS突变。不过,如前文所述,该领域真正取得突破是在2013年,当时Kevan Shoka团队在一篇Nature论文中公布了他们所开发的一款可选择性靶向KRAS(G12C)的抑制剂,该分子对野生型和其它突变版本的KRAS没有影响。如图1A所示,这一选择性抑制剂与突变半胱氨酸残基共价结合,占据“switch II region”的一个口袋(a pocket in the switch II region, SIIP)。

  之后,基于结构的优化导致了对KRAS(G12C)亲和力更强的抑制剂,如ARS853、ARS1620。这些抑制剂在多种肿瘤模型中以不同程度抑制KRAS(G12C)激活,减弱癌细胞增殖,以及诱导癌细胞死亡。其中,ARS1620还表现出能够在异种移植物模型中抑制肿瘤生长。

  得益于ARS化合物的结构-活性关系从早期就已公开,一些更有效的KRAS(G12C)抑制剂被开发出来。虽然这些抑制剂共享一个结合G12C的丙烯酰胺弹头,但它们有着不同的化学结构(图1A)。其中,sotorasib(也称为AMG510)和MRTX849能够有效抑制小鼠的异种移植瘤生长。据报道,它们的效力增强是由于其与KRAS(G12C)α3螺旋中的H95残基相互作用增强了。这种相互作用也被认为是ARS1620和1_AM效力强于ARS853的原因。令人兴奋的是,sotorasib和MRTX849现在都在KRAS(G12C)突变肿瘤患者中显示出了临床活性。

  9月20日,安进在顶级医学期刊NEJM杂志上公布了Sotorasib的完整I期试验结果。该I期试验(NCT03600883)共招募了129例患者,59例为非小细胞肺癌(NSCLC)、42例为结直肠癌、28例为其它类型的实体瘤。研究结果显示,安全性方面,未观察到剂量限制毒性效应或治疗相关的死亡。有73例患者(56.6%)发生了与治疗相关的不良事件,其中,15例(11.6%)患者发生了3级或4级TRAEs。疗效方面,在非小细胞肺癌(NSCLC)队列中,所有剂量组均可见抗癌活性,32.2%(19例)患者显示出明确的客观缓解(CR或PR),88.1%(52例) 患者疾病得到控制(客观缓解或病情稳定),中位无进展生存期为6.3个月。在结直肠癌队列中,有7.1%(3例)患者显示明确的缓解,73.8%(31例)患者疾病得到控制,中位无进展生存期为4.0个月。在胰腺癌、子宫内膜癌、阑尾癌和黑色素瘤患者中也观察到了缓解(各1例患者)。

  10月25日,Mirati Therapeutics在第32届国际分子靶标与癌症治疗学研讨会(EORTC-NCI-AACR)上发表了MRTX849(adagrasib)的最新临床数据。MRTX849单药治疗携带KRAS G12C突变的晚期/转移性非小细胞肺癌ORR达45%,疾病控制率达96%;单药治疗携带KRAS G12C突变的结直肠癌ORR为17%,疾病控制率为94%。

  除了靶向半胱氨酸残基的特异性抑制剂,其它靶向KRAS(G12C)的方法包括GDP类似物、KRAS(G12C)-GTP:cyclophylin A (CYPA)抑制剂等。这些新兴化合物的细胞效应正在评估中,尚不清楚它们是否具有与SIIP抑制剂相同或更好的KRAS抑制作用。

  二、临床开发

  来源:Cell

  据NextPharma数据库显示,目前全球有6款KRAS(G12C)抑制剂进入临床开发阶段,除了前文提到的Sotorasib (AMG510)、MRTX849(adagrasib),还包括由基因泰克开发的GDC6036、 由礼来开发的LY3499446、由强生和Wellspring Biosciences联合开发的JNJ74699157 (ARS3248)以及由中国新药研发公司益方生物开发的D-1553(NCT04585035)。此外,还有一些项目预计明年开启临床研究。

  三、联合治疗

  如图2所示,KRAS(G12C)抑制剂有多种联合治疗方向,包括联合靶向上游、下游或平行信号通路,以及细胞周期或免疫检查点。

  共靶向上游信号传导

  如图1C所示,抑制核苷酸交换可增强KRAS(G12C)停留在失活/药物敏感状态,增强KRAS(G12C)抑制剂的疗效。由于RTK激活是核苷酸交换的关键刺激,因此,联合靶向RTKs被用于增强KRAS(G12C)抑制剂的抗增殖效果。研究显示,RTK抑制剂直接增加了KRAS(G12C)抑制剂与靶点结合的能力。

  直接抑制RTKs下游的核苷酸交换对提升KRAS(G12C)抑制剂疗效也是有效的,如使用SOS1小干扰RNA (siRNAs)或SOS1选择性抑制剂(如BAY293或BI3406/BI1701963)。

  另一种方法是共靶向SHP2,这是一种磷酸酶,参与RTK依赖性SOS1/2激活。多项研究表明,SHP2抑制剂(如RMC4630和TNO155)可增强KRAS(G12C)抑制剂的抗增殖和抗肿瘤作用。基于这些结果,评估MRTX849/TNO155或sotorasib/RMC4630联合方案疗效的临床试验即将开展。

  共靶向并行信号传导

  尽管在KRAS(G12C)突变细胞中PI3K、AKT和MTOR的激活机制尚不清楚,但联合抑制KRAS(G12C)与PI3K或MTOR的抗肿瘤作用比单独抑制其中任一靶点都更显著。此外,同时抑制KRAS(G12C)、IGF1R和MTOR三个靶点也导致了较强的抗肿瘤作用。

  共靶向下游信号传导

  靶向RAF二聚体、MEK或ERK是增强KRAS(G12C)抑制剂的一种潜在方法。虽然MEK抑制剂被报道似乎没有显著增强ARS1620或MRTX849的效果,但能够增强sotorasib的抗肿瘤作用。目前,sotorasib+MEK抑制剂的联合治疗方案正在临床试验中进行测试。来自该试验的数据将为共靶向RAF/MEK/ERK信号级联和KRAS(G12C)能否带来益处提供关键证据。

  共靶向细胞周期检查点

  KRAS信号传导的一个关键输出是CyclinD:CDK4/6的激活。用palbociclib靶向CDK4/6来最大化细胞周期阻滞可增强KRAS(G12C)抑制剂的疗效。

  共靶向免疫检查点

  KRAS信号传导对肿瘤微环境具有免疫抑制作用。因此,KRAS(G12C)抑制可能会增强免疫检查点抑制的疗效。已有研究证实,当与PD-1抗体联合时,sotorasib导致了持久的抗肿瘤作用。相关临床试验正在进行中。不过,未来还需要做更多的工作来了解KRAS(G12C)是如何导致免疫抑制的。

  四、小结

  在过去7年里,KRAS药物研发取得了巨大的进步。研究者们认为,考虑到KRAS靶向药物研发先前遭遇的几十年的瓶颈以及KRAS突变在癌症患者中的普遍性,期待KRAS(G12C)选择性抑制剂的发现和临床开发能够开辟肿瘤精准治疗的新时代。

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