Molecular Cancer: m6A调节因子在小细胞肺癌中的作用:分子特征、免疫肿瘤学特征和临床相关性
肺癌仍然是世界上最常见、最致命的癌症。小细胞肺癌(SCLC)是最致命的肺癌,约占肺癌总病例的15%。SCLC是一种侵袭性高级别神经内分泌肿瘤,以倍增时间短、生长迅速和早期转移扩散为特征。大多数SCLC患者迅速产生耐药性,他们的5年生存率很低(5 - 6%),即使是在标准化疗初始反应良好的情况下。在小细胞肺癌的常规化疗中加入免疫检查点抑制剂是有希望的; 然而,它们的绝对长期收益是中等的。需要阐明SCLC广泛转移和复发的复杂机制,以扩大化疗和免疫治疗对更多患者的持久益处。
m6A是真核RNA中最丰富和最普遍的RNA修饰,是肿瘤生物学的重要组成部分。M6A修饰与其他表观遗传修饰相似,是一个受甲基转移酶、RNA结合蛋白和去甲基化酶调控的动态可逆过程。越来越多的证据强烈表明,m6A修饰是肿瘤转移、复发和治疗耐药的一个新的决定性因素,特别是抗pd -1/PD-L1单药耐药。多种表观遗传异常已被证实与SCLC的癌表型和侵袭性密切相关。然而,作为最常见的RNA表观遗传修饰,m6A从未被认为与SCLC进展有关。
这是对m6A调控因子的首次描述,包括其分子特征、免疫肿瘤学特征和临床相关性。该数据强调了m6A调节因子在肿瘤发病机制和肿瘤免疫微环境(TIME)形成中的重要性,并为制定针对SCLC患者m6A修饰的治疗策略奠定了合理的基础和支撑。
作者策划了30个m6A监管者的目录,包括11个writers,两个erasers和17个readers。在110例SCLC样本中检测30例m6A调控因子的体细胞突变。28个样本出现m6A调控因子突变,突变频率为25.5。在所有调控因子中,reader的突变频率相对较高,FMR1的突变频率最高。相比之下,没有erasers显示出突变。作者还注意到metttl3和YTHDC2以及IGF2BP2和YTHDC2之间同时发生突变。然后,作者从癌症细胞系百科全书中研究了这些调控因子在53个SCLC细胞系中的拷贝数变异。
由于m6A调控因子的基因改变在SCLC中很常见,作者应该确定这些改变是否影响表达模式。通过主成分分析评估m6A调节因子在正常肺和SCLC样本中的表达全景,发现其分布模式有显著差异。几乎所有的writers和readers在sclc中显著上调; 然而,erasers表达趋于下降,表明SCLC与丰富的m6A修饰有关。IGF2BP3在多种实体肿瘤中显著升高,本研究首次将这一现象扩展到SCLC。结合CNV结果和m6A调控子的表达模式,作者推测CNV的改变可能是m6A调控子表达紊乱的原因之一。
本研究首次描述了m6A调节因子在sclc中的异常表达模式、特异性免疫肿瘤特征和临床相关性。对sclc中m6A调节因子的全面评估将有助于人们加深对肿瘤发生和重塑TIME的理解,并提供更有效的化疗和免疫治疗选择。(生物谷 Bioon.com)
参考文献
Chaoqi Zhang et al. The landscape of m6A regulators in small cell lung cancer: molecular characteristics, immuno-oncology features, and clinical relevance. Mol Cancer 2021 Sep 27;20(1):122. doi: 10.1186/s12943-021-01408-5.
文章摘自网络,侵删
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