高黑色素瘤多基因风险与高紫外线辐射环境下的患者生存率提高有关
目前,人们对种系遗传因素在决定皮肤黑色素瘤(CM)生存率方面的作用还不是很清楚。近日,发表于J Transl Med的一项研究进行了全基因组关联研究(GWAS)黑色素瘤特异性生存率(MSS)的荟萃分析,并检验CM易感性多基因风险评分(PRS)是否与MSS有关。
研究人员利用澳大利亚黑色素瘤研究所的数据对MSS进行了两次Cox比例危险分析,该研究所是一个高紫外线(UV)辐射环境(MIA;5762名黑色素瘤患者;800名黑色素瘤死亡)和英国生物银行(UKB:5220名黑色素瘤患者;241名黑色素瘤死亡),并在固定效应荟萃分析中结合起来。在利兹黑色素瘤队列(LMC;1,947名黑色素瘤患者;370名黑色素瘤死亡者)中调查了显著性结果(P < 5 × 10-8)。
此外,研究人员还利用一个大型独立的GWAS荟萃分析(23,913例,342,870例对照)开发了一个CM易感性PRS。在MIA和UKB队列中测试了PRS与MSS的关系。
结果显示,在MIA和UKB的荟萃分析中,有两个位点与MSS显著相关,即1号染色体上的rs41309643(G等位基因频率1.6%,HR=2.09,95%CI=1.61-2.71,P=2.08×10-8)和7号染色体上的rs75682113(C等位基因频率1.8%,HR=2.38,95%CI=1.77-3.21,P=1.07×10-8)。虽然这两个SNP都没有在LMC中复制,但rs75682113在合并的发现和复制组中是显著相关的。校正了诊断时的年龄、性别和前十个主成分后,CM易感性PRS增加一个标准差与MSS的改善有关(HR = 0.88,95% CI = 0.83-0.94,P = 6.93 × 10-5;I2 = 88%)。然而,这只是由高紫外线环境的队列驱动的(MIA HR = 0.84, 95% CI = 0.78-0.90)。
综上所述,该研究发现了两个可能与MSS相关的基因座。在高紫外线环境下,患CM的遗传易感性增加与MSS的改善有关。
参考文献
https://cancer.cmt.com.cn/detail/1459298.html
文章摘自网络,侵删
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